RESUMO
Objective. To assess the population structure and genetic diversity in populations of domestic horse (Equus caballus) in the municipality Cienaga de Oro-Córdoba (Colombia). Materials and methods. Random sampling were conducted between August and October 2013, in adult animals on farms seven districts, which was carried out phenotypic characterization of each animal, based on autosomal markers encoding morphological Extension (E) , Agouti (A), Cream (C), White (W), Gray (G), Tobiano (TO), Overo (O) and Roan (RN). Population genetic parameters: allele frequency, genetic diversity, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium and genetic distance were calculated through the program POPGENE 1.31; the genetic structure was assessed using the program FSTAT v. 2.9.3.2. Results. 341 individuals were analyzed in the seven populations studied, where the Extension gene Was the MOST faq frequently as the Overo and Tobiano genes showed the lowest values. Insignificant values of genetic variability and population recorded a global level, likewise, low genetic differentiation among populations, accompanied by a high gene flow was obtained; an excess of heterozygotes at population and global level was observed; to this is added the presence of Hardy-Weinberg equilibrium in all populations relative to the markers studied and low genetic distance values ââwere reported. Conclusions. The populations are highly genetically related, a situation that may result from the existing geographical proximity between them, favoring genetic exchange and the establishment of a metapopulation.
Objetivo. Evaluar la estructura poblacional y la diversidad genética en poblaciones de caballo doméstico (Equus caballus), en el municipio Ciénaga de Oro, Córdoba (Colombia). Materiales y métodos. Se realizaron muestreos aleatorios entre los meses de Agosto y Octubre del año 2013, en animales adultos presentes en las fincas de siete corregimientos, donde se llevó a cabo la caracterización fenotípica a cada animal, atendiendo a los marcadores autosómicos de codificación morfológica Extension (E), Agouti (A), Cream (C), White (W), Gris (G), Tobiano (TO), Overo (O) y Roan (RN). Los parámetros genéticos poblacionales: frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio Hardy-Weinberg y distancia génica, fueron calculados a través del programa PopGene 1.31; la estructura genética se evaluó mediante el programa FSTAT v. 2.9.3.2. Resultados. Se analizaron 341 individuos en las siete poblaciones estudiadas, donde El marcador Extensión fue el de mayor frecuencia mientras los genes Overo y Tobiano presentaron los menores valores. Se registraron cifras poco significativas de variabilidad genética a nivel global y poblacional, así mismo, se obtuvo una escasa diferenciación genética entre las poblaciones, acompañado de un elevado flujo génico; se observó un exceso de heterocigotos a nivel poblacional y a nivel total, a esto se le suma la presencia de equilibrio Hardy-Weinberg en todas las poblaciones con relación a los marcadores estudiados y se reportaron valores bajos de distancia genética. Conclusiones. Las poblaciones se encuentran muy relacionadas genéticamente, situación que puede obedecer a la cercanía geográfica existente entre ellas, favoreciendo el intercambio genético y la constitución de una metapoblación.
Assuntos
Cavalos , Colômbia , Áreas AlagadasRESUMO
Objective. The purpose of this study was to characterize a population of domestic pig (Sus scrofa domestica) in Cereté, Córdoba, using 20 microsatellite; calculate heterozygosity per locus and average heterozygosity. Materials and methods. Hair samples were collected from 62 specimens. DNA was extracted by proteinase K digestion and phenol-chloroform purification. Information from 20 microsatellites was selected out of those recommended for swine biodiversity studies. PCR products were separated by a vertical polyacrylamide gel electrophoresis. The bands were visualized by staining with silver nitrate. Results. All microsatellites used were polymorphic. Between 3 (SW1067) and 15 (IFNG) alleles were detected with an average number of 6.7 and a total de 134 alleles. The average expected and observed heterozygosities were 0.5278 and 0.5479, respectively. PIC values ranged between 0.1999 and 0.8300 for loci SW1067 and SW911, respectively. Conclusions. Levels of observed and expected heterozygosity found in the present study indicate that the domestic pig (Sus scrofa domestica) in Córdoba Cereté show high degree of genetic variability.
Objetivo. El objetivo del presente estudio fue caracterizar una población de cerdo doméstico (Sus scrofa domestica) en Cereté, Córdoba utilizando 20 microsatélites; calcular la heterocigosidad por locus y la heterocigosidad media. Materiales y métodos. Se recolectaron muestras de bulbos de pelo de 62 ejemplares. El ADN se extrajo mediante digestión con proteinasa K y una purificación con fenol-cloroformo. Se utilizó la información proporcionada por 20 marcadores microsatélites de los recomendados para estudios de biodiversidad porcina. Los productos de PCR se separaron mediante electroforesis vertical en gel de poliacrilamida. Las bandas se visualizaron por tinción con nitrato de plata Resultados. Todos los microsatélites utilizados fueron polimórficos. Se detectaron, entre 3 (SW1067) y 15 (IFNG) alelos, con un número medio de alelos de 6.7 y un total de 134. Las heterocigosidades media esperadas y observadas fueron 0.5278 y 0.5479 respectivamente. Los valores del PIC oscilaron entre 0.1999 y 0.8300 para los loci SW1067 y SW911 respectivamente. Conclusiones. Los niveles de heterocigosidad observada y esperada encontrados en el presente estudio, indican que el cerdo doméstico (Sus scrofa domestica) en Cereté Córdoba muestran alto grado de variabilidad genética.
